Как я вылечила клебсиеллу у ребенка
Так часто получается, что многие мамы не знают о том, что кишечник малыша после рождения стерилен и все, что попадает в его организм с молочком или питанием заселяет кишечник мгновенно.
Мы с моей доченькой столкнулись с очень не приятной инфекцией, которую, как нам объяснили позже мы подхватили в больнице. Дело в том, что не смотря на то, что в больнице очень следят за соблюдением санитарных норм и даже пеленки проходят через стерилизацию, автоклав, инфекцию там подхватить проще простого, да и еще устойчивую ко многим способам лечения.
Вообще больничные инфекции довольно сложно лечить, так как они «выжили», если можно так выразиться, не смотря на многочисленные обработки различными способами и препаратами.
После выписки я заметила, что у моей малышки очень жидкий стул, мы сдали кал на анализы и у нас выявил клебсиеллу в содружестве со стафилококком.
Потом мне объяснила моя свекровь, которая по удачному стечению обстоятельств врач микробиолог, что клебсиелла это условно патогенных микроорганизм, который допустим в определенном количестве в здоровой среде кишечника, но когда его количество превышает допустимые нормы начинаются следующие проблемы со здоровьем у малыша.
- из-за того, что клебсиелла выстилает поверхность кишечника, фактически заполоняя собой всю флору, полезные микроорганизмы идут на убыль и начинают расти и размножаться патогенные, вроде стафилококка.
- при этой инфекции ребенка мучают газы и частый, жидкий стул, характерный пенящейся консистенцией, со слизью и кислым запахом;
- вздутие животика и колики;
- температура около 37 — 37,5;
Чем опасна клебсиелла
Если не лечить клебсиеллу, то можно получить очень серьезные последствия для здоровья ребенка. Этот микроорганизм может поселиться и в других органах малыша неизбежно вызывая там воспалительные процессы.
Как мы вылечили клебсиеллу
Вытравить эту дрянь из кишечника нам удалось не с первого раза. После проведенных исследований и выяснения, какой вид клебсиеллы у нас и к чему она чувствительна, врач назначила нам бактериофаг нужного вида и энтерофурил.
Бактериофаг (буквально, пожиратель бактерий) – вирус, который нападает на клетку бактерии, проникает в нее и начинает там размножаться. Бактерия разрушается, выпуская наружу потомство. За 30-40 минут рождаются сотни новых бактериофагов. И так до тех пор, пока бактерии не закончатся.
Энтерофурил — противомикробный препарат широкого спектра действия, не обладающий системным действием и применяемый для лечения диареи инфекционной этиологии.
В результате через некоторое время анализы снова показали превышение по клебсиелле, снова вздутие и пенящийся стул.
Второй раз мы решили поступить по другому
Мы сначала пропили энтерофурил, а затем добили оставшиеся вредные бактерии фагом тем же курсом, что и в первый раз. И тогда смогли победить эту дрянь. Главное делать все по времени и верной дозировке.
Важно помнить, что при любых проблемах со стулом нужно сдать анализы на патогенную флору. Не заниматься самолечением.
При этом не забывать давать ребенку обильное питье, потому что на фоне частого жидкого стула у него появляется обезвоживание, организм ослабевает и инфекция прогрессирует с удвоенной силой.
Здоровья вам и вашему малышу.
ПОХОЖИЕ СТАТЬИ:
Дети и их здоровье. Корь — как распознать
ПодробнееСимптомы краснухи у детей и взрослых — чем опасна эта болезнь
ПодробнееВетряная оспа, признаки, последствия, лечение.
Подробнеесимптомы, причины, методы лечения, отзывы : Labuda.blog
Сразу после появления на свет практически все системы и органы ребенка находятся в стадии дозревания. Поэтому они подвержены различным заболеваниям, вызванным условно-патогенной флорой. К таковым относятся бактерии, которые живут на слизистых и коже человека. Однако под воздействием некоторых факторов они начинают приносить вред организму. К числу подобных причисляется клебсиелла. В сегодняшней статье мы более подробно рассмотрим, какими симптомами сопровождается ее активность, что необходимо предпринять в качестве терапевтической меры.
Клебсиелла у грудничка в кале — что это значит?
Клебсиелла — это грамотрицательная бактерия, имеющая вид палочки. Впервые ее описание представил немецкий патологоанатом Эдвин Клебс. Микроб относится к категории анаэробных, то есть он размножается исключительно в бескислородной среде. Однако и на воздухе клебсиелла в течение длительного времени может сохранять свою жизнеспособность. При кипячении она гибнет.
Выделяют 8 видов бактерий. У маленьких детей преимущественно встречаются только два из них: клебсиелла пневмония и клебсиелла окситока. Они обитают в кишечнике и каловых массах, на коже и слизистых оболочках. Пока иммунитет полноценно работает, бактерия не представляет опасности. При ослабевании защитной системы условно-патогенная флора начинает активно развиваться, отравляя организм. У маленьких детей иммунитет находится в стадии формировании, а слизистые практически стерильны. Поэтому заражение клебсиеллой может привести к серьезным заболеваниям.
Основные причины
Многих родителей пугает выявление клебсиеллы у грудничка в кале. Что это за бактерия, мы рассказали чуть выше. По каким причинам она может появиться?
Условно все причины принято разделять на две группы: внешние и внутренние. К первой категории относятся:
- контакт младенца с инфицированным взрослым человеком;
- распространение бактерии посредством грязной воды, игрушек или больных животных;
- употребление в пищу зараженных продуктов.
Проникая в организм, клебсиелла не всегда представляет опасность даже для маленького организма. Нередко она вступает в своеобразный симбиоз с микрофлорой хозяина и начинает участвовать в основных процессах жизнедеятельности. Возможность провоцировать развитие воспалительных заболеваний возникает при бурном росте бактерии.
Среди внутренних причин можно выделить:
- ослабленный иммунитет;
- дисбаланс внутренней микрофлоры кишечника;
- аллергия на некоторые продукты питания;
- нехватка «полезных» бактерий на фоне антибактериальной терапии;
- присутствие в кишечнике патогенной флоры, которая уничтожает здоровую.
Достаточно часто клебсиелла выявляется вместе со стафилококком. Эти бактерии существуют сообща. Как только стафилококки заканчивают уничтожение полезных микроорганизмов, клебсиеллы занимают их место своими колониями.
Клиническая картина
Клебсиелла пневмония у детей дошкольного возраста встречается редко. Наиболее распространенна ее кишечная разновидность. Однако самостоятельно выявить ее родителям трудно. По причине недостаточно сформированной микрофлоры кишечника у новорожденных часто развивается дисбактериоз, за который часто и воспринимают клебсиеллезную инфекцию. Поэтому при подозрении на недуг без медицинской помощи не обойтись.
Основными симптомами клебсиеллы в кале у грудничка выступают следующие:
- вздутие и повышенное газообразование в животе;
- колики;
- частые и обильные срыгивания «фонтаном»;
- лихорадка и гипертермия;
- понос с примесями слизи;
- кислый запах от фекалий.
Активное размножение бактерии может привести к обезвоживанию организма.
Симптомы клебсиеллы пневмонии у грудничка схожи с таковыми при ОРВИ. Повышается температура до 38-39 градусов, появляется сильный сухой кашель. Через несколько дней он становится влажным, может выделяться мокрота с прожилками крови и неприятным запахом. При этом ребенок становится капризным и вялым, отказывается от пищи.
Появление перечисленных симптомов требует незамедлительного обращения к педиатру. Доктор должен назначить обследование на выявление патогенных микроорганизмов.
Методы диагностики
При возникновении симптомов клебсиеллы у грудничка лечением и диагностикой должен заниматься педиатр или гастроэнтеролог. Диагноз устанавливается по результатам лабораторных исследований. Для анализа выполняется забор:
- кала;
- мочи;
- крови;
- мокроты;
- отделяемого из носовой или ротовой полости.
Для получения полной клинической картины может потребоваться общий анализ крови и копрограмма.
Поскольку активность бактерии в организме не сопровождается специфическими симптомами, в ходе комплексного обследования маленького пациента необходимо исключить заболевания с похожими проявлениями. Клебсиеллу дифференцируют от стафилококка и различных патологий ЖКТ.
Результаты обследования могут вызвать беспокойство только в случае превышения нормативных значений числа бактерий в грамме биоматериала. В идеале этот показатель не должен быть более 106.
Когда проведенные анализы подтверждают и имеются симптомы клебсиеллы у грудничка в кале, диагностируется клебсиеллезный гастроэнтерит. При этом количество бактерий в грамме биологического материала составляет 10
Принципы лечения
Основная опасность бактерии — наличие крепкой капсулы, которая защищает ее от действия активных веществ лекарственных средств. Поэтому ее обнаружение в анализах сопровождается длительной терапией, которая чаще всего проводится в условиях стационара. Одновременно она преследует несколько целей: уничтожение непосредственно патогенных агентов, восстановление баланса кишечной микрофлоры. На весь период лечения дополнительно требуется соблюдение диеты со стороны мамы, если малыш находится на грудном вскармливании, или ребенка.
Грудничков обычно стараются оградить от применения антибиотиков. Если инфекционная патология имеет смешанный характер, а ее признаки не пропадают в течение длительного времени, от использования антибактериальных средств отказываться нельзя.
Известный детский педиатр Комаровский имеет свое мнение по данному вопросу. Он полагает, что даже при наличии симптомов клебсиеллы у грудничка в кале лечение специфического характера не требуется. Лекарства практически не влияют на активность бактерии. По его мнению, достаточно наладить режим питания маме и ребенку, нормализовать стул, заниматься укреплением иммунитета доступными методами. Со временем иммунная система малыша окрепнет, а сами бактерии продолжат мирно сосуществовать в его организме вместе с полезными.
Применение антибиотиков
Лечение клебсиеллы у грудничка антибиотиками показано в следующих случаях:
- осложненная форма патологии, когда ее течение сопровождается стафилококком или иными бактериологическими поражениями;
- отсутствие эффективности от альтернативной терапии;
- высокий риск осложнений.
В перечисленных случаях маленькому пациенту назначают цефалоспорины 3-4 поколения («Цефтриаксон», «Супракс»). Стоит заметить, что бактерия проявляет устойчивость к антибиотикам пенициллиновой и оксациллиновой групп.
Все медикаменты подбираются индивидуально. Первоначально «забранную» из мочи или кала ребенка клебсиеллу в лабораторных условиях подвергают атаке несколькими противомикробными средствами. Тот препарат, который сумеет убить ее, будет выбран в качестве основного для терапии. Его дают совместно с иммуномодуляторами для повышения способности иммунитета ребенка к сопротивлению. Весь этот процесс обычно занимает от 7 до 21 суток. Он обязательно протекает под врачебным контролем во избежание распространения инфекции на другие органы. Кроме того, при низкой резистенции выбранный изначально антибиотик заменяют другим.
После окончания курса приема препаратов требуется восстановить равновесие микрофлоры. Поскольку их применение убивает и полезные бактерии, а не только клебсиеллу у грудничка.
Лечение бактериофагами
Если маленький пациент после подтверждения диагноза хорошо себя чувствует, идеальным вариантом для уменьшения количества колоний бактерий в кишечнике считается применение бактериофагов. Это специально созданные вирусы, которые воздействуют исключительно на источник недуга. Они не наносят вред остальным микроорганизмам, не нарушают баланс полезной микрофлоры в ЖКТ. Курс лечения обычно составляет до 3 недель.
Необходимость в регидратации
Организм взрослого примерно на 75 % состоит из воды, а новорожденного — на 90 %. Поэтому так важно своевременно пополнять запасы жидкости. В случае кишечной инфекции ребенок быстро теряет в весе, происходит обезвоживание. Впоследствии достаточно трудно провести регидратацию — восполнение воды в организме, поэтому нельзя допускать критических значений.
Симптомы клебсиеллы у грудничка проявляются в виде рвоты и жидкого стула. Вместе с каловыми и рвотными массами выходит вода, запасы минеральных солей. При появлении первых симптомов нарушения следует начинать отпаивать ребенка.
Врачи с этой целью рекомендуют популярный препарат «Регидрон». Это порошок, расфасованный по пакетикам. Содержимое одного из них нужно развести в литре воды, дать малышу. Полученный раствор имеет в своем составе необходимые соли и минералы. Однако существенным его недостатком является достаточно неприятный вкус.
Специально для грудничков были разработаны аналоги «Регидрона» с различными вкусовыми добавками. Например, «Хумана Электролит» и «Гастролит». Они дополнительно содержат фенхель, который отвечает за снятие спазмов и вздутие живота.
Когда в домашней аптечке нет специальных препаратов для регидратации, можно воспользоваться минеральной водой или приготовить ее самостоятельно. Потребуется в литре воды смешать 18 г сахара и 3 г соли. Основное правило регидратации — поить маленькими глотками. В зависимости от возраста пациента разовая доза составляет 1-2 чайные ложки. В противном случае поступающая в организм жидкость спровоцирует очередной выброс рвоты. В особо серьезных случаях, когда симптомы клебсиеллы у грудничка длительное время не проходят, подобную процедуру проводят в условиях стационара и с использованием капельниц.
Применение пробиотиков
Основными показаниями к назначению пробиотиков выступают следующие случаи:
- Самостоятельная терапия для устранения клебсиеллы. Речь идет о слабых формах недуга, когда ребенка ничего не беспокоит.
- Одна из мер восстановительного лечения. После курса терапии, особенно с применением антибиотиков, необходимо заселить кишечник полезной микрофлорой.
С этой целью для устранения симптомов клебсиеллы у грудничка и лечения используются «Бифиформ малыш», «Бифидус», «Примадофилус Бейби». Препараты выпускаются в форме порошка. Их удобно добавлять в воду или молоко. Пробиотики позволяют быстро восстановить работу ЖКТ, избавить ребенка от проблем со стулом.
Возможные опасности и последствия
Выбор метода устранения симптомов клебсиеллы у грудничка всегда остается за врачом. Прогноз на выздоровление и длительность проведения терапии во многом определяются своевременностью обращения к педиатру со стороны родителей. Именно поэтому важно не заниматься самолечением. Даже обычные рвота и понос могут быть причиной клебсиеллы. При появлении этих признаков необходимо вызвать врача.
В случае ухудшения клинической картины, когда стремительно повышается температура и присутствует сильная диарея, увеличивается на этом фоне риск обезвоживания, следует вызвать «Скорую помощь». Бояться инфекционного стационара не стоит. В условиях медучреждения ребенку будет оказана необходимая помощь, назначено грамотное лечение.
Стоит заметить, что симптомы клебсиеллы в кишечнике у грудничка не ограничиваются нарушением стула. В запущенной и агрессивной форме недуг может привести к менингиту, негативно отразиться на состоянии суставов, вызвать бактериальный системный сепсис. Несмотря на то что вероятность возникновения подобных осложнений мала, рисковать жизнью ребенка не стоит.
Отзывы родителей
Согласно отзывам, симптомами и лечением клебсиеллы у грудничка в кале или моче должен заниматься педиатр. Самостоятельные попытки терапии в таком случае оказываются не только не эффективны, но могут спровоцировать развитие осложнений.
Большинство родителей, детям которых пришлось столкнуться с этой бактерией, предупреждают о длительной терапии. Однако бояться антибиотиков не стоит. Современные препараты, назначаемые врачами для лечения детям, помогают справиться с клебсиеллой практически без последствий. Важно только соблюдать все рекомендации педиатра, не пренебрегать на этапе восстановления пробиотиками и бактериофагами.
Способы профилактики
Симптомы клебсиеллы у грудничка, по отзывам родителей, практически всегда проявляются рвотой и диареей. Лечение лишь в некоторых случаях обходится без применения антибиотиков. Поэтому родители желают любыми способами предостеречь своего ребенка от этой бактерии.
Профилактика сводится в первую очередь к укреплению иммунитета, а не к созданию стерильной чистоты в домашних условиях. Для этого даже новорожденный ребенок достаточно времени должен проводить на свежем воздухе. В его рационе должны присутствовать необходимые витамины и микроэлементы, обеспечивающие полноценную работу всего организма.
При появлении первых признаков любой болезни не стоит давать малышу сразу сиропы и таблетки. Все дело в том, что разнообразные вирусы и бактерии буквально тренируют иммунитет, который постепенно формирует антитела к разным возбудителям недугов. В попытках укрепить иммунитет некоторые родители начинают давать иммуномодуляторы и иммуностимуляторы. В профилактических целях их использование не рекомендуется. Исключение составляют подтвержденные случаи иммунодефицитов, когда подобные препараты прописывает врач в качестве основной терапии.
Сопутствующая профилактика появления симптомов клебсиеллы у грудничка основывается на соблюдении элементарных правил и норм гигиены. Взрослые зачастую даже не догадываются, что являются носителями этой бактерии. Поэтому они должны каждый раз после туалета мыть руки с мылом. Непосредственно самому ребенку также необходимо мыть руки с мылом, особенно после контакта с животными, прогулки.
Воздушно-капельным путем передается только одна разновидность бактерии — клебсиелла пневмония. Предупредить ее проникновение в организм достаточно трудно. Можно лишь избегать мест повышенного скопления людей.
Снизить частоту заболеваемости могут и сами родители уже заразившегося ребенка. После подтверждения диагноза по анализам они должны ограничить общение малыша со сверстниками, совместное использование игрушек и постельными принадлежностями до полного выздоровления.
Автор: Софья Андреева
симптомы, причины, методы лечения, отзывы
Сразу после появления на свет практически все системы и органы ребенка находятся в стадии дозревания. Поэтому они подвержены различным заболеваниям, вызванным условно-патогенной флорой. К таковым относятся бактерии, которые живут на слизистых и коже человека. Однако под воздействием некоторых факторов они начинают приносить вред организму. К числу подобных причисляется клебсиелла. В сегодняшней статье мы более подробно рассмотрим, какими симптомами сопровождается ее активность, что необходимо предпринять в качестве терапевтической меры.
Клебсиелла у грудничка в кале — что это значит?
Клебсиелла — это грамотрицательная бактерия, имеющая вид палочки. Впервые ее описание представил немецкий патологоанатом Эдвин Клебс. Микроб относится к категории анаэробных, то есть он размножается исключительно в бескислородной среде. Однако и на воздухе клебсиелла в течение длительного времени может сохранять свою жизнеспособность. При кипячении она гибнет.
Выделяют 8 видов бактерий. У маленьких детей преимущественно встречаются только два из них: клебсиелла пневмония и клебсиелла окситока. Они обитают в кишечнике и каловых массах, на коже и слизистых оболочках. Пока иммунитет полноценно работает, бактерия не представляет опасности. При ослабевании защитной системы условно-патогенная флора начинает активно развиваться, отравляя организм. У маленьких детей иммунитет находится в стадии формировании, а слизистые практически стерильны. Поэтому заражение клебсиеллой может привести к серьезным заболеваниям.
Основные причины
Многих родителей пугает выявление клебсиеллы у грудничка в кале. Что это за бактерия, мы рассказали чуть выше. По каким причинам она может появиться?
Условно все причины принято разделять на две группы: внешние и внутренние. К первой категории относятся:
- контакт младенца с инфицированным взрослым человеком;
- распространение бактерии посредством грязной воды, игрушек или больных животных;
- употребление в пищу зараженных продуктов.
Проникая в организм, клебсиелла не всегда представляет опасность даже для маленького организма. Нередко она вступает в своеобразный симбиоз с микрофлорой хозяина и начинает участвовать в основных процессах жизнедеятельности. Возможность провоцировать развитие воспалительных заболеваний возникает при бурном росте бактерии.
Среди внутренних причин можно выделить:
- ослабленный иммунитет;
- дисбаланс внутренней микрофлоры кишечника;
- аллергия на некоторые продукты питания;
- нехватка «полезных» бактерий на фоне антибактериальной терапии;
- присутствие в кишечнике патогенной флоры, которая уничтожает здоровую.
Достаточно часто клебсиелла выявляется вместе со стафилококком. Эти бактерии существуют сообща. Как только стафилококки заканчивают уничтожение полезных микроорганизмов, клебсиеллы занимают их место своими колониями.
Клиническая картина
Клебсиелла пневмония у детей дошкольного возраста встречается редко. Наиболее распространенна ее кишечная разновидность. Однако самостоятельно выявить ее родителям трудно. По причине недостаточно сформированной микрофлоры кишечника у новорожденных часто развивается дисбактериоз, за который часто и воспринимают клебсиеллезную инфекцию. Поэтому при подозрении на недуг без медицинской помощи не обойтись.
Основными симптомами клебсиеллы в кале у грудничка выступают следующие:
- вздутие и повышенное газообразование в животе;
- колики;
- частые и обильные срыгивания «фонтаном»;
- лихорадка и гипертермия;
- понос с примесями слизи;
- кислый запах от фекалий.
Активное размножение бактерии может привести к обезвоживанию организма.
Симптомы клебсиеллы пневмонии у грудничка схожи с таковыми при ОРВИ. Повышается температура до 38-39 градусов, появляется сильный сухой кашель. Через несколько дней он становится влажным, может выделяться мокрота с прожилками крови и неприятным запахом. При этом ребенок становится капризным и вялым, отказывается от пищи.
Появление перечисленных симптомов требует незамедлительного обращения к педиатру. Доктор должен назначить обследование на выявление патогенных микроорганизмов.
Методы диагностики
При возникновении симптомов клебсиеллы у грудничка лечением и диагностикой должен заниматься педиатр или гастроэнтеролог. Диагноз устанавливается по результатам лабораторных исследований. Для анализа выполняется забор:
- кала;
- мочи;
- крови;
- мокроты;
- отделяемого из носовой или ротовой полости.
Для получения полной клинической картины может потребоваться общий анализ крови и копрограмма.
Поскольку активность бактерии в организме не сопровождается специфическими симптомами, в ходе комплексного обследования маленького пациента необходимо исключить заболевания с похожими проявлениями. Клебсиеллу дифференцируют от стафилококка и различных патологий ЖКТ.
Результаты обследования могут вызвать беспокойство только в случае превышения нормативных значений числа бактерий в грамме биоматериала. В идеале этот показатель не должен быть более 106.
Когда проведенные анализы подтверждают и имеются симптомы клебсиеллы у грудничка в кале, диагностируется клебсиеллезный гастроэнтерит. При этом количество бактерий в грамме биологического материала составляет 108. В случае концентрации в мокроте свыше 106 на грамм, врач делает заключение о клебсиеллезной пневмонии.
Принципы лечения
Основная опасность бактерии — наличие крепкой капсулы, которая защищает ее от действия активных веществ лекарственных средств. Поэтому ее обнаружение в анализах сопровождается длительной терапией, которая чаще всего проводится в условиях стационара. Одновременно она преследует несколько целей: уничтожение непосредственно патогенных агентов, восстановление баланса кишечной микрофлоры. На весь период лечения дополнительно требуется соблюдение диеты со стороны мамы, если малыш находится на грудном вскармливании, или ребенка.
Грудничков обычно стараются оградить от применения антибиотиков. Если инфекционная патология имеет смешанный характер, а ее признаки не пропадают в течение длительного времени, от использования антибактериальных средств отказываться нельзя.
Известный детский педиатр Комаровский имеет свое мнение по данному вопросу. Он полагает, что даже при наличии симптомов клебсиеллы у грудничка в кале лечение специфического характера не требуется. Лекарства практически не влияют на активность бактерии. По его мнению, достаточно наладить режим питания маме и ребенку, нормализовать стул, заниматься укреплением иммунитета доступными методами. Со временем иммунная система малыша окрепнет, а сами бактерии продолжат мирно сосуществовать в его организме вместе с полезными.
Применение антибиотиков
Лечение клебсиеллы у грудничка антибиотиками показано в следующих случаях:
- осложненная форма патологии, когда ее течение сопровождается стафилококком или иными бактериологическими поражениями;
- отсутствие эффективности от альтернативной терапии;
- высокий риск осложнений.
В перечисленных случаях маленькому пациенту назначают цефалоспорины 3-4 поколения («Цефтриаксон», «Супракс»). Стоит заметить, что бактерия проявляет устойчивость к антибиотикам пенициллиновой и оксациллиновой групп.
Все медикаменты подбираются индивидуально. Первоначально «забранную» из мочи или кала ребенка клебсиеллу в лабораторных условиях подвергают атаке несколькими противомикробными средствами. Тот препарат, который сумеет убить ее, будет выбран в качестве основного для терапии. Его дают совместно с иммуномодуляторами для повышения способности иммунитета ребенка к сопротивлению. Весь этот процесс обычно занимает от 7 до 21 суток. Он обязательно протекает под врачебным контролем во избежание распространения инфекции на другие органы. Кроме того, при низкой резистенции выбранный изначально антибиотик заменяют другим.
После окончания курса приема препаратов требуется восстановить равновесие микрофлоры. Поскольку их применение убивает и полезные бактерии, а не только клебсиеллу у грудничка.
Лечение бактериофагами
Если маленький пациент после подтверждения диагноза хорошо себя чувствует, идеальным вариантом для уменьшения количества колоний бактерий в кишечнике считается применение бактериофагов. Это специально созданные вирусы, которые воздействуют исключительно на источник недуга. Они не наносят вред остальным микроорганизмам, не нарушают баланс полезной микрофлоры в ЖКТ. Курс лечения обычно составляет до 3 недель.
Необходимость в регидратации
Организм взрослого примерно на 75 % состоит из воды, а новорожденного — на 90 %. Поэтому так важно своевременно пополнять запасы жидкости. В случае кишечной инфекции ребенок быстро теряет в весе, происходит обезвоживание. Впоследствии достаточно трудно провести регидратацию — восполнение воды в организме, поэтому нельзя допускать критических значений.
Симптомы клебсиеллы у грудничка проявляются в виде рвоты и жидкого стула. Вместе с каловыми и рвотными массами выходит вода, запасы минеральных солей. При появлении первых симптомов нарушения следует начинать отпаивать ребенка.
Врачи с этой целью рекомендуют популярный препарат «Регидрон». Это порошок, расфасованный по пакетикам. Содержимое одного из них нужно развести в литре воды, дать малышу. Полученный раствор имеет в своем составе необходимые соли и минералы. Однако существенным его недостатком является достаточно неприятный вкус.
Специально для грудничков были разработаны аналоги «Регидрона» с различными вкусовыми добавками. Например, «Хумана Электролит» и «Гастролит». Они дополнительно содержат фенхель, который отвечает за снятие спазмов и вздутие живота.
Когда в домашней аптечке нет специальных препаратов для регидратации, можно воспользоваться минеральной водой или приготовить ее самостоятельно. Потребуется в литре воды смешать 18 г сахара и 3 г соли. Основное правило регидратации — поить маленькими глотками. В зависимости от возраста пациента разовая доза составляет 1-2 чайные ложки. В противном случае поступающая в организм жидкость спровоцирует очередной выброс рвоты. В особо серьезных случаях, когда симптомы клебсиеллы у грудничка длительное время не проходят, подобную процедуру проводят в условиях стационара и с использованием капельниц.
Применение пробиотиков
Основными показаниями к назначению пробиотиков выступают следующие случаи:
- Самостоятельная терапия для устранения клебсиеллы. Речь идет о слабых формах недуга, когда ребенка ничего не беспокоит.
- Одна из мер восстановительного лечения. После курса терапии, особенно с применением антибиотиков, необходимо заселить кишечник полезной микрофлорой.
С этой целью для устранения симптомов клебсиеллы у грудничка и лечения используются «Бифиформ малыш», «Бифидус», «Примадофилус Бейби». Препараты выпускаются в форме порошка. Их удобно добавлять в воду или молоко. Пробиотики позволяют быстро восстановить работу ЖКТ, избавить ребенка от проблем со стулом.
Возможные опасности и последствия
Выбор метода устранения симптомов клебсиеллы у грудничка всегда остается за врачом. Прогноз на выздоровление и длительность проведения терапии во многом определяются своевременностью обращения к педиатру со стороны родителей. Именно поэтому важно не заниматься самолечением. Даже обычные рвота и понос могут быть причиной клебсиеллы. При появлении этих признаков необходимо вызвать врача.
В случае ухудшения клинической картины, когда стремительно повышается температура и присутствует сильная диарея, увеличивается на этом фоне риск обезвоживания, следует вызвать «Скорую помощь». Бояться инфекционного стационара не стоит. В условиях медучреждения ребенку будет оказана необходимая помощь, назначено грамотное лечение.
Стоит заметить, что симптомы клебсиеллы в кишечнике у грудничка не ограничиваются нарушением стула. В запущенной и агрессивной форме недуг может привести к менингиту, негативно отразиться на состоянии суставов, вызвать бактериальный системный сепсис. Несмотря на то что вероятность возникновения подобных осложнений мала, рисковать жизнью ребенка не стоит.
Отзывы родителей
Согласно отзывам, симптомами и лечением клебсиеллы у грудничка в кале или моче должен заниматься педиатр. Самостоятельные попытки терапии в таком случае оказываются не только не эффективны, но могут спровоцировать развитие осложнений.
Большинство родителей, детям которых пришлось столкнуться с этой бактерией, предупреждают о длительной терапии. Однако бояться антибиотиков не стоит. Современные препараты, назначаемые врачами для лечения детям, помогают справиться с клебсиеллой практически без последствий. Важно только соблюдать все рекомендации педиатра, не пренебрегать на этапе восстановления пробиотиками и бактериофагами.
Способы профилактики
Симптомы клебсиеллы у грудничка, по отзывам родителей, практически всегда проявляются рвотой и диареей. Лечение лишь в некоторых случаях обходится без применения антибиотиков. Поэтому родители желают любыми способами предостеречь своего ребенка от этой бактерии.
Профилактика сводится в первую очередь к укреплению иммунитета, а не к созданию стерильной чистоты в домашних условиях. Для этого даже новорожденный ребенок достаточно времени должен проводить на свежем воздухе. В его рационе должны присутствовать необходимые витамины и микроэлементы, обеспечивающие полноценную работу всего организма.
При появлении первых признаков любой болезни не стоит давать малышу сразу сиропы и таблетки. Все дело в том, что разнообразные вирусы и бактерии буквально тренируют иммунитет, который постепенно формирует антитела к разным возбудителям недугов. В попытках укрепить иммунитет некоторые родители начинают давать иммуномодуляторы и иммуностимуляторы. В профилактических целях их использование не рекомендуется. Исключение составляют подтвержденные случаи иммунодефицитов, когда подобные препараты прописывает врач в качестве основной терапии.
Сопутствующая профилактика появления симптомов клебсиеллы у грудничка основывается на соблюдении элементарных правил и норм гигиены. Взрослые зачастую даже не догадываются, что являются носителями этой бактерии. Поэтому они должны каждый раз после туалета мыть руки с мылом. Непосредственно самому ребенку также необходимо мыть руки с мылом, особенно после контакта с животными, прогулки.
Воздушно-капельным путем передается только одна разновидность бактерии — клебсиелла пневмония. Предупредить ее проникновение в организм достаточно трудно. Можно лишь избегать мест повышенного скопления людей.
Снизить частоту заболеваемости могут и сами родители уже заразившегося ребенка. После подтверждения диагноза по анализам они должны ограничить общение малыша со сверстниками, совместное использование игрушек и постельными принадлежностями до полного выздоровления.
Клебсиелла у грудничка
Молодые родители, в большинстве случаев, обращают свое внимание на плач грудничков из-за частого поноса, сопровождающегося болями в животе и вздутием. Надеяться, что эти симптомы нормальны для этого промежутка жизни ребенка не стоит, причиной тому может являться заболевание клебсиелла. Если не обращать внимание на симптомы, то возможны осложнения.
Клебсиелла – относится к семейству энтеробактерий и является патогенным организмом. Попавшая во внутрь бактерия, поразив толстую кишку, способна нарушить функции желудочно-кишечного тракта, а в редких случаях может вызвать пневмонию.
Для взрослого здорового человека, палочка не столь опасна и не сможет проявится, развиться, до тех пор пока иммунная система находится выше или равна норме. Она даже способна находится в организме без вреда, но стоит иммунитету упасть, бактерия незамедлительно начнет поражать организм.
Груднички болеют частенько, так как у них иммунитет очень слабый, а защита организма еще не сформировалась и находится на низком уровне.
Бактерия может попасть вовнутрь разными способами, основными причинами ребенка можно считать грязные руку, шерсть животных, выпитой воды или с грудного молока. Родители должны серьезно отнестись, не только к гигиене ребенка или своей личной гигиены, но и за гигиеной среды в которой находится ребенок.
Клебсиелла очень распространена, так как для ее существования не требуются какие-то особые условия для развития, поэтому следует строго соблюдать общую гигиену. А в роддомах, детских поликлинниках, больницах или иных медицинских учреждениях, должны соблюдать все санитарные нормы. К большому сожалению именно в медицинских учреждениях их больше чем хотелось бы и встречается бактерия наиболее часто. Нередко случалось, что ребенок был заражен именно в роддоме, где родители уже не в силах защитить ребенка.
Симптомы клебсиелла у ребенка.
Определить, что в организме грудничка находится палочка сложно, ведь дисбактериоз, имея похожие симптомы, способен ввести в заблуждение не только родителей ребенка.
Груднички часто подвержены таким заболеваниям как колики и вздутие живота, срыгивание и метеоризм. Это все является причиной для необходимости большего внимания за состоянием здоровья ребенка.
Стул грудничка жидкий и чаще со слизью, возможно с сопровождением крови, и обязательно с присутствием резкого кисломолочного запаха. Так же наблюдается повышение температуры до 37,2 которая не падает ниже этих градусов, сопровождаясь лихорадкой. Постоянно увеличивающиеся боли живота, и возможно мучащее организм ребенка обезвоживание.
Как было сказано выше, развитие клебсиеллы зависит от иммунной системы грудничка. Медленное развитие заболевания, может обеспечить высокий иммунитет, который и даст время родителям, для предоставления помощи грудничку без скорой. Но имея низкий иммунитет, и плюс, к тому переболев недавно какое-либо заболевание, принимая при этом антибиотики, даст возможность клебсиелле развиться в считанные часы с последующей срочной госпитализацией.
Если все симптомы присутствуют у грудничка, то в течении некоторого времени возможно обезвоживание и увеличение интоксикации организма. Следует срочно, обратится в больницу, вызвав скорую помощь. Иначе это может привести к иным тяжким заболеваниям, требующим более серьезного вмешательства.
Возможные последствия клебсиеллы в организме.
Обнаружив в организме ребенка клебсиеллу, не стоит паниковать. Если предоставить лечение вовремя, то большее чего можно ожидать – это легкое инфекционное заболевание, излечимое без труда, за короткое время, и без каких-либо последствий.
В случае обнаружения палочки уже на поздней стадии развития или же снижение иммунной системы, будьте готовы к возможности начала серьезных заболеваний, лечение которых стоит предоставить квалифицированным специалистам. Выделяют следующие заболевания, способные появится после клебсиеллы:
1. Пневмония(воспаление легких).
2. Кишечные инфекции.
3. Менингит.
4. Коньюктивит
5. Сильная форма насморка, перетекающая в гайморит.
Не стоит волноваться, даже при обнаружении бактерии в слабом организме ребенка. Постарайтесь лучше в короткие сроки проконсультироваться со специалистом, выполнять все указания врача, после проведения тщательного медицинского осмотра.
Лечение клебсиеллы грудничка.
При обнаружении первых признаков палочки, следует, незамедлительно обратится к специалисту, для своевременного лечения и сдачи требующихся анализов. Потребуется сдать анализы кала, взяв посев с которого, определяются причины такого слабого состояния ребенка и возможные заболевания.
Выявив симптомы, не стоит переходить к самостоятельному лечению, а что самое главное не надейтесь на нетрадиционную медицину, именно она приводит к потери времени, а в худших случаях ухудшению состояния. Только врач способен определить болезнь и назначить лечение, так как частый итог, выявляющаяся болезнь с такими симптомами оказывается дисбактериоз. Не теряйте время, обеспечьте ребенку скорое выздоровление, обратившись к врачу и сделав требующие анализы.
Но если посев показывает присутствие палочки, незамедлительно пройдите всех требующихся врачей, пройдите назначенные обследования, после чего специалисты сделают вывод о нанесенном вреде и методе лечения данного этапа заболевания.
Грудное вскармливание будет отличной поддержкой слабому организму, при клебсиелле. Прежде чем кормить ребенка грудью, стоит сдать все требуемые анализы, убедившись в собственном здоровье.
Легкое и быстрое лечение будет возможным с помощью синбиотиков, пребиотиков и бактериофагий, только при своевременном обнаружении заболевания. Данное лечение позволяет нормализовать микрофлору кишечника, и действует как антисептик. При тяжелом случае заболевания, назначаются антибиотики, лечение должно проходить под контролем врачей.
В редких случаях клебсиеллу выявляют у ребенка без каких либо признаков, тогда требуется вытеснить лишние микроорганизмы из организма с помощью определенных препаратов. Также назначают лечение по увеличению иммунной системы организма и нормализации работы всего кишечника.
Автор публикации: Зоя Киселёва Klebsiella pneumoniae в медицинских учреждениях | HAI
Общая информация
Klebsiella [kleb-see-ell-uh] — это тип грамотрицательных бактерий, которые могут вызывать различные типы инфекций, связанных со здоровьем, в том числе пневмонию, инфекции кровотока, инфекции раны или места операции и менингит. Все чаще у бактерий Klebsiella развивается резистентность к противомикробным препаратам, совсем недавно к классу антибиотиков, известных как карбапенемы. Klebsiella бактерии обычно находятся в кишечнике человека (где они не вызывают заболевания). Они также найдены в человеческом стуле (кал). В медицинских учреждениях случаев заражения клебсиеллой обычно возникают среди больных пациентов, которые получают лечение от других заболеваний. Пациенты, для лечения которых требуются такие устройства, как вентиляторы (дыхательные аппараты) или внутривенные (вены) катетеры, а также пациенты, проходящие длительные курсы определенных антибиотиков, наиболее подвержены риску инфекций клебсиеллы .Здоровые люди обычно не получают инфекций Klebsiella .
Как бактерий Klebsiella распространяются
Чтобы заразиться Klebsiella , человек должен быть подвержен воздействию бактерий. Например, Klebsiella должен попасть в дыхательные пути (дыхательные пути), чтобы вызвать пневмонию, или в кровь, чтобы вызвать инфекцию кровотока.
В медицинских учреждениях бактерии Klebsiella могут распространяться при непосредственном контакте с человеком (например, от пациента к пациенту через загрязненные руки медицинского персонала или других лиц) или, реже, при загрязнении окружающей среды.Бактерии не распространяются по воздуху.
Пациенты в медицинских учреждениях также могут подвергаться воздействию Klebsiella , когда они находятся на аппаратах ИВЛ (дыхательных аппаратах) или имеют внутривенные (венозные) катетеры или раны (вызванные травмой или операцией). К сожалению, эти медицинские инструменты и условия могут позволить Klebsiella проникнуть в организм и вызвать инфекцию.
Предотвращение распространения клебсиеллы
Чтобы предотвратить распространение инфекций Klebsiella между пациентами, медицинский персонал должен соблюдать определенные меры предосторожности при инфекционном контроле (см. Руководство по мерам предосторожности при изоляции: предотвращение передачи инфекционных агентов в медицинских учреждениях 2007 г.).Эти меры предосторожности могут включать в себя строгое соблюдение гигиены рук и ношение халатов и перчаток при входе в помещения, где размещаются пациенты с заболеваниями, связанными с клебсиеллой . Медицинские учреждения также должны соблюдать строгие процедуры очистки, чтобы предотвратить распространение Klebsiella .
Во избежание распространения инфекции пациентам также следует очень часто чистить руки, в том числе:
- Перед приготовлением или приемом пищи
- Прежде чем касаться их глаз, носа или рта
- До и после смены повязок на рану или бинтов
- После пользования туалетом
- После сморкания, кашля или чихания
- После прикосновения к больничным поверхностям, таким как поручни кровати, тумбочки, дверные ручки, пульты дистанционного управления или телефон
Лекарственная устойчивость Klebsiella
Некоторые бактерии Klebsiella стали очень устойчивыми к антибиотикам.Когда бактерии, такие как Klebsiella pneumoniae , продуцируют фермент, известный как карбапенемазу (называемый организмом, продуцирующим КПК), класс антибиотиков, называемый карбапенемами, не будет работать для уничтожения бактерий и лечения инфекции. Виды клебсиелл являются примерами Enterobacteriaceae, нормальной части кишечных бактерий человека, которая может стать устойчивой к карбапенемам.
CRE, которая обозначает устойчивые к карбапенемам Enterobacteriaceae, представляет собой семейство микробов, которые трудно поддаются лечению, поскольку они имеют высокий уровень устойчивости к антибиотикам.К сожалению, карбапенемные антибиотики часто являются последней линией защиты от грамотрицательных инфекций, устойчивых к другим антибиотикам.
Лечение Klebsiella инфекций
Klebsiella инфекции, которые не являются лекарственно устойчивыми, можно лечить с помощью антибиотиков. Инфекции, вызываемые бактериями, продуцирующими КПК, могут быть трудно поддающимися лечению, потому что против них действует меньше антибиотиков. В таких случаях лаборатория микробиологии должна проводить тесты, чтобы определить, какие антибиотики будут лечить инфекцию.
Что делать пациентам, если они думают, что у них клебсиеллезных заболеваний ?
Обратитесь к врачу.
Что следует делать пациентам, если им поставлен диагноз , связанных с клебсиеллой, ?
Они должны соблюдать режим лечения, предписанный лечащим врачом. Если поставщик медицинских услуг назначает антибиотик, пациенты должны принимать его в точности так, как это предписывает поставщик медицинских услуг. Пациенты должны пройти назначенный курс лечения, даже если симптомы исчезли.Если лечение прекращается слишком рано, некоторые бактерии могут выжить, и пациент может заразиться снова. Пациенты должны мыть руки как можно чаще и соблюдать все другие гигиенические рекомендации.
Как кто-то узнает, что его инфекция Klebsiella устойчива к лекарствам?
Медицинский работник назначит лабораторные анализы, чтобы определить, является ли инфекция Klebsiella устойчивой к лекарствам.
Может ли инфекция Klebsiella распространиться на членов семьи пациента?
Если члены семьи здоровы, у них очень низкий риск заражения Klebsiella .Все еще необходимо соблюдать все меры предосторожности, особенно гигиену рук. Klebsiella бактерии распространяются в основном при контакте с человеком, и гигиена рук является лучшим способом предотвращения распространения микробов.
Рекомендации и руководящие указания
Для получения дополнительной информации о профилактике и лечении HAI, см. Ресурсы ниже:
,Как анкилозирующий спондилит (AS), так и болезнь Крона (CD) являются хроническими и потенциально приводящими к инвалидности взаимосвязанными состояниями, которые были включены в группу спондилоартропатий. Результаты большого количества исследований подтверждают идею о том, что энтеропатический патоген, Klebsiella pneumoniae , является наиболее вероятным запускающим фактором, вовлеченным в возникновение и развитие этих заболеваний.Повышенное потребление крахмала генетически восприимчивыми индивидуумами, такими как обладающие аллотипами HLA-B27, может вызвать заболевание как в AS, так и в CD, усиливая рост и сохранение микробов Klebsiella в кишечнике. Воздействие повышенных уровней этих микробов приведет к выработке повышенных уровней антител против Klebsiella , а также аутоантител против перекрестно-реактивных аутоантигенов с результирующими патологическими поражениями кишечника и суставов.Следовательно, уменьшение количества крахмалосодержащих продуктов в ежедневном рационе может оказать благоприятное терапевтическое воздействие на заболевание, особенно при использовании в сочетании с доступными в настоящее время медицинскими методами лечения пациентов с АС и CD.
1. Введение
Анкилозирующий спондилит (АС) рассматривается как прототип серонегативных спондилоартропатий (SpAs), которые составляют группу связанных со спондилитом состояний. Другие заболевания SpA включают реактивный артрит, псориатический артрит, недифференцированный SpA и артрит, связанный с воспалительным заболеванием кишечника (IBD), которое включает в себя болезнь Крона (CD) и язвенный колит (UC) [1].SpAs представляют собой взаимосвязанные состояния, которые имеют определенные связанные клинические, лабораторные, рентгенологические и генетические проявления, такие как воспалительная боль в спине, вызванная спондилитом / сакроилиитом, а также асимметричный олигоартрит, энтезопатия, передний увеит, положительный семейный анамнез и связь с генами HLA-B27. , но без позитива к ревматоидным факторам.
Хотя у пациентов с CD обычно присутствуют клинические признаки поражения кишечника, характерным проявлением у пациентов с AS и ассоциированным со спондилитом CD является прогрессирующая воспалительная боль в спине с или без других признаков, связанных с SpA [2].
Как AS, так и CD влияют на ранние возрастные группы и имеют всемирное распространение. В Соединенном Королевстве есть по крайней мере один миллион человек, которые страдают от некоторых особенностей AS. Негативное влияние АС на занятость [3] и психологический [4] статус пациентов с этим заболеванием хорошо известно. Заболевание при CD также может влиять на социальный статус и трудоспособность пациентов, особенно у женщин [5]. Из-за этих негативных воздействий на общее состояние здоровья и благосостояния пациентов с AS и CD, с некоторыми недостатками используемых в настоящее время медицинских методов лечения, поиск причинного фактора и альтернативной терапевтической меры, включающей устранение причины, может быть полезен в ведение пациентов с этими заболеваниями.
2. Генетическое происхождение AS и CD
Положительный семейный анамнез является одним из ключевых моментов в определении характеристик пациентов с SpA. В семейном исследовании пробандов АС и здорового контроля в исландской популяции было показано, что существуют доказательства, которые могут подтвердить существование общих генетических компонентов для АС и ВЗК. Исследование продемонстрировало соотношение риска 3,0 и 2,1 у родственников первой и второй степени, соответственно, в отношении возникновения АС в семьях пробандов с ВЗК и возникновения ВЗК в семьях пациентов с АС [6].В более недавнем исследовании было показано, что существует генетическое совпадение аутоиммунных заболеваний, включая AS и IBD [7]. Таким образом, представляется, что некоторые общие генетические факторы могут действовать при развитии обоих заболеваний при AS и CD.
Частота ассоциации аллотипов HLA-B27 у пациентов с АС рассматривается как самая сильная генетическая связь с любым заболеванием, которое встречалось в области ревматологии [8]. Эта генетическая связь была обнаружена в начале 1970-х годов, когда было обнаружено, что более 95% пациентов с АС обладают HLA-B27, тогда как частота этого гена в общей популяции была ниже 10% [9, 10].Другие заболевания в группе SpA имеют более низкую, но разную степень ассоциации с этим аллелотипом. Например, частота этого аллотипа у пациентов с IBD / CD без ассоциированного артрита сравнима с таковой в нормальной популяции, но увеличивается у 40–60% у пациентов со спондилитом / сакроилиитом [11]. Эти данные показывают, что спондилоартропатический пациент с поражением позвоночника имеет больше шансов обладать генами HLA-B27, чем у пациентов с поражением только периферических суставов.Помимо HLA-B27, другие гены, независимо от того, находятся ли они внутри или вне области главного комплекса гистосовместимости, также участвуют в этиопатогенезе как AS [12], так и CD [13].
3. Связь между AS и CD
Существуют определенные характеристики, связывающие AS и CD, ассоциированные со спондилитом, на основе общих генетических, клинических, иммунологических и микробных особенностей [14]. Кроме того, считается, что большинство, если не все условия SpA, имеют фундаментальную связь с поражениями кишечника и энтеробактериальными микробами [15].Например, около 10 процентов пациентов с АБ имеют явное ВЗК, в то время как у 70% пациентов с АБ имеется субклинический терминальный илеит [16]. Осевой и периферический артрит могут встречаться у 30% пациентов с CD [17], а распространенность AS может возрасти до 6% у пациентов с CD [18]. Кроме того, HLA-B27-положительные пациенты с ВЗК имели более высокий шанс развития АБ по сравнению с пациентами без ВЗК [19]. У крыс, трансгенных по HLA-B27, самопроизвольно развивается хроническое воспалительное заболевание, которое клинически и гистологически напоминает SpA человека, тогда как у контрольных крыс, трансгенных по HLA-A2, такое заболевание не развивается [20].Эти результаты подтверждают роль кишечной и кишечной флоры в развитии SpAs в основном у генетически восприимчивых людей, таких как те, которые обладают генами HLA-B27. Тем не менее, до 30 процентов пациентов с неклассифицированными HLA-B27-положительными воспалительными ревматическими заболеваниями развиваются в одну форму определенной группы SpA, такую как AS, IBD или реактивный артрит [21]. Также сообщалось, что более половины пациентов с недифференцированным SpA разовьют AS в течение определенного периода времени [22].
Из этих результатов следует, что как HLA-B27, так и воспаление кишечника играют ключевую роль в развитии SpAs, особенно AS и CD, и что основной этиопатогенетический процесс запускается генетическими и экологическими (главным образом, микробными) факторами.
4. Доказательства субклинических микробных инфекций при AS и CD
Первые доказательства эпидемиологической связи между инфекцией и SpA были обнаружены в начале двадцатого века, когда триада симптомов, состоящая из уретрита, конъюнктивита и артрита, называлась как Синдром Рейтера был обнаружен в группе солдат, живущих в негигиеничных условиях во время Первой мировой войны после нескольких приступов инфекции [23].Это условие, однако, было позже признано как форма реактивного артрита, которому, как известно, предшествуют инфекции энтерогенными или урогенитальными бактериями [24].
Предыдущий обзорный анализ показал, что результаты молекулярных, иммунологических и микробиологических исследований могут установить связь между субклинической инфекцией Klebsiella и этиопатогенезом как AS [25, 26], так и CD [14, 27]. Доказательства этих ссылок суммируются следующим образом.
4.1. Klebsiella и AS
(A) Кролики, иммунизированные HLA-B27-позитивными лимфоцитами, показали повышенную гемагглютинирующую активность против эритроцитов овец, покрытых Klebsiella липолисахаридом, и эти повышения были статистически значимы по сравнению с образцами сыворотки, полученными из тех же образцов. кролики до иммунизации [28]. Также было показано, что HLA-B27-позитивные аллогенные сыворотки, типизирующие ткани человека, более значительно связывались с микробами Klebsiella по сравнению с сыворотками, содержащими другие антитела, специфичные к HLA-ткани [29].(B) Моноклональные антитела против HLA-B27 связываются с Klebsiella , Shigella и Yersinia , энтеробактериальными агентами [30], что указывает на существование некоторых общих или перекрестно-реактивных антигенов среди этих микробов. Было обнаружено, что другие моноклональные антитела против B27 связываются более предпочтительно с Klebsiella , чем с микробными антигенами Shigella и Yersinia [31]. (C) Обнаружено, что гомологичная аминокислотная последовательность, QTDRED, присутствующая в HLA-B27 имеют молекулярное сходство с другой последовательностью энзима Klebsiella pneumonia редуктазы редуктазы [32].Было обнаружено, что между продуктов секреции Klebsiella и аутоантигенами существуют более гомологичные аминокислотные последовательности. Четырехмерная последовательность DRDE, присутствующая в ферментах pulle-D-Pulleanase Klebsiella, имеет гомологию с последовательностью DRED, присутствующей в молекулах HLA-B27. Было обнаружено, что другая гомологичная последовательность существует между ферментами пуллуланазы pul-A Klebsiella, которые имеют трипептидную последовательность «Gly-X-Pro», и этот же антиген присутствует в коллагене типов I, III и IV [33].(D) Различные иммунологические исследования, проведенные независимыми группами из 16 разных стран, показали, что антитела против K. pneumonia и / или перекрестно-реактивных аутоантигенов, но не против других микроорганизмов, значительно повышены среди пациентов с AS по сравнению с пациентами. с другими заболеваниями или со здоровыми людьми [34]. (E) Было обнаружено, что уровни антител против Klebsiella значительно выше в сыворотке, чем в образцах синовиальной жидкости, взятых у пациентов с АС [35].Источники этих антител поступают из внесуставных областей, таких как лимфатические узлы, дренирующие кишку [36]. (F) Образцы сыворотки, взятые у активных пациентов с АС, обладают значительной цитотоксической активностью in vitro по сравнению с сыворотками, взятыми у пациентов с РА или здоровый контроль. Повышенный процент лизиса присутствует в эритроцитах овец, которые были покрыты перекрестно-реактивными антигенами Klebsiella , такими как синтетические пептиды HLA-B27, QTDRED [37]. (G) Антитела к пептидам Klebsiella редуктазы редуктазы, QTDRED, было показано, что они преимущественно связываются с синовиальными тканями пациентов с АС по сравнению с таковыми у пациентов с другими ревматическими заболеваниями [38].(H) Бактерии Klebsiella были выделены различными независимыми группами более значительно из кишечника активных пациентов с АС по сравнению с контрольной группой [39–42]. Эти данные, однако, не были подтверждены другими группами [43, 44]. Расхождения в этих результатах могут быть объяснены различиями в методах сбора и культивирования образцов фекалий и статуса активности заболевания. Кроме того, в исследовании, проведенном группой из Финляндии, было показано, что повышенные уровни антител IgA против Klebsiella у пациентов с АС коррелировали со степенью воспаления кишечника [45].
Хорошо известно, что существует сильная связь между воспалением кишечника [46] и / или AS [47, 48]. Уровень общего [49] и секреторного IgA иммуноглобулинов [50] увеличился у большинства пациентов с АС. Более того, имеются данные о повышенных уровнях IgA, в частности секреторных антител IgA против антигенов Klebsiella [51–53] или перекрестно-реактивных антигенов Klebsiella [54] у активных пациентов с АС. Результаты этих исследований, связывающих Klebsiella , коллаген и HLA-B27 с АС, могут объяснить некоторые из преобладающих характерных клинических, генетических и иммунологических особенностей, присутствующих у пациентов с этим заболеванием (Таблица 1).
|
4.2. Klebsiella и CD
(A) Предыдущие исследования показали, что Klebsiella микробов были выделены из образцов толстой кишки более чем у 25% пациентов с CD [55], и что рецидивы заболевания у пациентов с Было обнаружено, что CD связан с колитом Klebsiella [56]. (B) Серологические и иммунологические исследования связи между Klebsiella и пациентами с IBD / CD были проведены различными группами из шести различных гастроэнтерологических центров.(a) Повышенные уровни антител против Klebsiella и против иерсинии наблюдались у пациентов с CD и UC из Бирмингема по сравнению с соответствующими здоровыми контрольными субъектами [57]. (b) Обе группы пациентов с IBD и AS из Глазго [58] и Эдинбурга [59], как было показано, имели значительно повышенные уровни антител против Klebsiella IgA по сравнению с соответствующими здоровыми контролями. (c) Три последовательных исследования из Лондона и Винчестера в Великобритании показали аналогичные результаты.В одном исследовании было обнаружено, что уровни антител против Klebsiella были значительно повышены у пациентов с AS, CD и UC по сравнению со здоровыми или контролями заболеваний, хотя такого повышения антител не наблюдалось против Escherichia или анаэробных кишечных микробов. (Рисунок 1) [60]. Во втором исследовании повышенные уровни специфичных для класса антител против многих капсульных серотипов бактерий Klebsiella были обнаружены у пациентов с CD и AS по сравнению с пациентами с целиакией или со здоровыми контрольными субъектами [61].В третьем исследовании было обнаружено, что специфичные для класса антитела против микробов Klebsiella и перекрестно-реактивного коллагена типов I, III, IV и V значительно повышены у пациентов с АС, а также в ранних и поздних случаях с БК по сравнению с здоровым субъектам. В том же исследовании образцы сыворотки от пациентов с CD показали положительную корреляцию между уровнями антител к Klebsiella и типами I, III и IV коллагена [62].
Кроме того, экспериментальные исследования в Нагакуте в Японии показали, что коллаген-индуцированный энтероколит [63] и артрит [64] наблюдались у животных при иммунизации гомологичными экстрактами толстой кишки и коллагенами вместе с липополисахаридами Klebsiella .
5. Этиопатогенный механизм, связывающий Klebsiella с AS и CD
Предполагается, что гипотеза молекулярной мимикрии или перекрестной реактивности является основным механизмом, который может связывать Klebsiella с инициацией и развитием AS и связанного со спондилитом CD [65 ]. Данные, полученные при других заболеваниях, таких как ревматическая лихорадка [66] и первичный билиарный цирроз печени [67], указывают на то, что молекулярная мимикрия — это больше, чем эпифеномен, благодаря которому гуморальные и / или клеточные иммунные ответы последовательно обнаруживаются в отношении целевых тканей в патологических участках у пациентов с эти условия.
Типы перекрестно-реактивных антител, продуцируемых после инфекций Klebsiella , будут определять анатомическое расположение патологических очагов, особенно при АС. Некоторые антитела реагируют с HLA-B27, антигеном, который экспрессируется в большинстве суставных тканей внутри синовиальных суставов, тогда как другие антитела реагируют с коллагеном I, III и IV типов, которые образуют важный компонент тканей позвоночника, где патологические поражения локализованы. Связывание этих перекрестно-реактивных антител Klebsiella , когда они присутствуют в высоких титрах, запускает воспалительные каскады, такие как система комплемента, вместе с продукцией различных цитокинов, что приводит к патологическим изменениям с последующим фиброзом, кальцификацией и образованием новой кости, приводящим к развитие классической АС.Кроме того, повышенный уровень экспрессии антигена HLA-B27 на тканях-мишенях у пациентов с АС [68] сделает эти молекулы более доступными и, следовательно, увеличит вероятность их связывания с перекрестно-реактивными антителами против Klebsiella .
.Введение
Klebsiella pneumoniae представляет собой все более сложный бактериальный патоген человека, вызывающий внутрибольничные или внутрибольничные инфекции, которые связаны с высоким уровнем устойчивости к антибиотикам (Wyres and Holt, 2016; Европейский центр профилактики и контроля заболеваний [ECDC], 2017). Исследования разнообразия населения показали, что К.pneumoniae филогенетически тесно связан с K. quasipneumoniae (subps. quasipneumoniae и subsp. similipneumoniae ) и K. variicola (Brisse and Verhoef, 2001; Holt et al., 2015; 2017). До недавних таксономических обновлений (Rosenblueth et al., 2004; Brisse et al., 2014) K. pneumoniae и другие вышеуказанные таксоны были сконструированы как K. pneumoniae филогруппы Kp1, Kp2, Kp4 и Kp3 соответственно ( Brisse et al., 2004). Вместе с двумя новыми филогруппами (Kp5 и Kp6), которые были недавно описаны (Blin et al., 2017), эти таксоны составляют комплекс K. pneumoniae . Обратите внимание, что Kp6 соответствует филогруппе, которую предлагается назвать K. quasivariicola (Long et al., 2017a). K. pneumoniae ( sensu stricto ) является основной причиной инфекций человека и животных в комплексе. Тем не менее, участие в инфекциях человека других участников комплекса получает признание (Brisse et al.2004; Секи и др., 2013; Maatallah et al., 2014; Holt et al., 2015; Breurec et al., 2016; Becker et al., 2018). К сожалению, непригодность традиционных методов клинической микробиологии для различения видов в комплексе приводит к высоким показателям ошибочной идентификации (чаще всего K. pneumoniae ), которые маскируют истинное клиническое значение каждой филогруппы и их потенциальные эпидемиологические особенности (Brisse et al. ., 2004; Seki et al., 2013; Long et al., 2017b; Becker et al.2018). Фактически, различные члены комплекса K. pneumoniae могут быть надежно идентифицированы только на основе секвенирования всего генома (WGS) или секвенирования специфических генетических маркеров (например, bla LEN , bla OKP , bla SHV , rpoB, gyrA, parC ) (Haeggman et al., 2004; Brisse et al., 2014; Holt et al., 2015). Однако последние методы недоступны для большинства обычных лабораторий и ограничены по скорости, стоимости и пропускной способности.В последние годы были разработаны некоторые методы идентификации на основе ПЦР, но они подвержены ошибкам или не различают все филогруппы (Brisse et al., 2004; Bialek-Davenet et al., 2014b; Garza-Ramos et al., 2015 ; Фонсека и др., 2017). Очевидно, что существует потребность в надежном, экономически эффективном и быстром способе идентификации, способном различать членов комплекса K. pneumoniae .
Масс-спектрометрия (MS) времени лазерной десорбции с помощью матричной лазерной десорбции (MALDI-TOF) произвела революцию в повседневной идентификации микроорганизмов, являясь быстрым и экономически эффективным методом.В настоящее время он представляет собой метод идентификации первой линии во многих клинических, экологических и пищевых микробиологических лабораториях (van Belkum et al., 2017). В случае комплекса K. pneumoniae идентификация MALDI-TOF MS остается в значительной степени неудовлетворительной, учитывая отсутствие хорошо охарактеризованных, представительных членов комплекса в спектральных базах данных. В настоящее время только K. pneumoniae и K. variicola включены в базу данных Bruker, и идентификация даже этих двух видов является неточной, учитывая отсутствие эталонных спектров других филогрупп (Berry et al.2015; Long et al., 2017b; Dinkelacker et al., 2018). Чтобы устранить это важное ограничение современной технологии MALDI-TOF MS, мы использовали коллекцию хорошо охарактеризованных штаммов из шести сложных филогрупп K. pneumoniae и проанализировали их с помощью MALDI-TOF MS, чтобы определить потенциал этого метода для идентифицировать виды в комплексе K. pneumoniae (Rodrigues et al., 2018). Кроме того, мы проверили нашу модель на основе MS MALDI-TOF, используя тестовый набор из 49 изолятов, принадлежащих к К.комплекс pneumoniae , со спектрами, полученными из различных питательных сред и процедур экстракции.
Материалы и методы
Бактериальные штаммы
Набор из 46 штаммов, ранее идентифицированных WGS или с использованием последовательностей генов ядра (Bialek-Davenet et al., 2014a; Brisse et al., 2014; Blin et al., 2017; Passet and Brisse, 2018) были проанализированы в этом исследовании. (Дополнительная таблица S1). Штаммы принадлежали таксонам K. pneumoniae ( sensu stricto , т.е.е. кр1; n = 10), K. quasipneumoniae subsp. quasipneumoniae (Kp2, n = 9), K. quasipneumoniae subsp. similipneumoniae (Kp4, n = 7), K. variicola (Kp3, n = 9) и двум таксономически неопределенным линиям, названным Kp5 ( n = 6) и ‘ K. quasivariicola ‘(Kp6, n = 5). Штаммы представляли собой разнообразие типов мультилокусной последовательности (MLST) внутри каждой филогруппы.Штаммы хранили в инфузионном бульоне сердца мозга, содержащем 25% глицерина при -80 ° С, и субкультивировали перед использованием в этом исследовании.
Приобретение Spectra
Ночную культуру на агаре Лурия-Бертани (37 ° С, 18 ч) использовали для приготовления образцов с помощью процедуры экстракции этанолом / муравьиной кислотой в соответствии с рекомендациями производителя (Bruker Daltonics, Бремен, Германия). Образцы (1 мкл) были нанесены на пластинку-мишень MBT Biotarget 96, высушены на воздухе и покрыты 1 мкл насыщенного матричного раствора α-циано-4-гидроксицинаминовой кислоты (HCCA) в 50% ацетонитрила и 2.5% трифторуксусной кислоты. Масс-спектры получали на масс-спектрометре Microflex LT (Bruker Daltonics, Бремен, Германия) с использованием параметров по умолчанию (обнаружение в линейном положительном режиме, частота лазера 60 Гц, напряжения источника ионов 2,0 и 1,8 кВ, напряжение линзы 6 кВ) в пределах м / з из 2000–20 000. Для каждого штамма было получено в общей сложности 24 спектра из восьми независимых пятен (три спектра на пятно, инструментальные повторы, один день) в соответствии с протоколом основного спектра (MSP).Внешнюю калибровку масс-спектров проводили с использованием Bruker Bacterial Test Standard (BTS).
Анализ спектров
Спектры были предварительно обработаны с применением процедур «сглаживания» и «вычитания базовой линии», доступных в программном обеспечении FlexAnalysis (Bruker Daltonics, Бремен, Германия), экспортированных в виде списков пиков со значениями m / z и интенсивностями сигналов для каждого пика в текстовом формате. и импортированы в специальную базу данных BioNumerics v7.6 (Applied Maths, Ghent, Belgium).Обнаружение пиков было выполнено в BioNumerics с использованием отношения сигнал / шум 20. Инструментальные повторы (24 спектра для каждого штамма) были использованы для генерации среднего спектра для каждого штамма с использованием следующих параметров: минимальное сходство, 90%; минимальный уровень обнаружения пиков, 60%; постоянный допуск, 1; и линейный допуск, 300 частей на миллион. Наконец, сопоставление пиков было выполнено для поиска всех различных пиков (называемых классами пиков в био-числах) с использованием в качестве параметров: постоянный допуск, 1,9; линейный допуск, 550 промилле; максимальный горизонтальный сдвиг, 1; пиковая частота обнаружения, 10.Различающее значение каждого результирующего пика оценивали по критерию Манна-Уитни (Vranckx et al., 2017). Чтобы проверить и проверить наши результаты, в базе данных BioNumerics был создан проект идентификации, использующий наши спектры в качестве эталонного набора и машину опорных векторов (SVM, контролируемый алгоритм) в качестве классификатора (процедура перекрестной проверки). Применение алгоритмов классификатора SVM очень полезно для различения групп, когда различия минимальны (DeMarco and Ford, 2013).В процедуре перекрестной проверки 70% доступных данных (выбранных случайным образом) использовались в качестве модели, тогда как 30% оставшихся спектров использовались в качестве теста для оценки доли (%) правильных прогнозов для каждой филогруппы. Для выделения белков, связанных с конкретными пиками, был использован онлайн-инструмент TagIdent. Фактически, этот инструмент позволяет идентифицировать белки по их массе, учитывая все белки, доступные в базе знаний UniProt (Swiss-Prot и TrEMBL) для исследуемой таксономической группы.Кроме того, с помощью BioNumerics было построено дерево соседних соединений на основе ранжированного коэффициента Пирсона.
Набор данных внешней проверки
Сорок девять изолятов, принадлежащих K. pneumoniae филогруппы Kp1 ( n = 23), Kp2 ( n = 7), Kp3 ( n = 7), Kp4 ( n = 9) и Kp5 ( n = 3), ранее охарактеризованные с помощью WGS, использовались для оценки надежности метода MALDI-TOF MS (изоляты Kp6, отличные от тех, которые использовались при построении модели, не были доступны).Эти изоляты являются частью исследовательской коллекции, полученной из образцов фекалий здоровых носителей на Мадагаскаре (2015–2016 годы) (в рамках BioProject PRJEB29143). Тестовые изоляты Kp1 включали продуценты ферментов ESBL или AmpC и представляли собой снимок клинически значимых множественных лекарственно-устойчивых подлиний (2 изолята ST17, 2 ST48, 2 ST101, 1 ST20, 1 ST25, 1 ST45, 1 ST307, 1 ST375 , 1 ST380). Изоляты из Kp3 и Kp4 были выбраны случайным образом, и были включены все доступные изоляты Kp2 и Kp5.Чтобы оценить влияние различных культуральных сред и различных процедур экстракции, спектры были получены в трех экземплярах с использованием четырех различных экспериментальных условий: бактерии выращивались в течение ночи на агаре Лурия-Бертани (37 ° С, 18 ч) и колумбийский агар плюс 5% овец. кровь (37 ° С, 18 ч) и из каждой культуры либо непосредственно переносили на мишени MALDI, либо экстрагировали клетки (используя процедуру экстракции этанолом / муравьиной кислотой). Полученные спектры MALDI-TOF затем проецировались в нашей модели с использованием ранее созданного проекта идентификации.
Результаты и обсуждение
Сорок шесть штаммов, представляющих разнообразие генотипов в шести филогруппах, известных в настоящее время в комплексе K. pneumoniae (дополнительная таблица S1), были проанализированы с помощью MALDI-TOF MS. На основании версии базы данных MALDI Biotyper Compass 4.1.80 (Bruker Daltonics, Бремен, Германия) 46 штаммов были идентифицированы как K. pneumoniae (31 штамм, все принадлежащие к Kp1, Kp2, Kp4 и Kp6) или как К. variicola (15 штаммов, все штаммы Kp3 и Kp5).Показатели идентификации варьировались от 2,16 до 2,56 для K. pneumoniae и от 1,89 до 2,55 для K. variicola. Следует отметить, что в двух случаях (Kp1-SB1139 и Kp6-SB6071) в одном измерении было сообщено о повторении как K. pneumoniae , а в другом — K. variicola . Эти данные подчеркивают необходимость обновления базы данных с целью повышения достоверности идентификации K. pneumoniae / K. variicola и обеспечения возможности идентификации K. quasipneumoniae и новых филогрупп.
На рис. 1 суммированы положения пиков, найденные в каждом штамме. Большинство (около 97%) пиков были сосредоточены в области ниже 10000 m / z , и пиков почти не было обнаружено выше этой величины. Сходство спектров в комплексе K. pneumoniae всегда было выше 87% (данные не показаны), причем пики при 4363, 5379, 6287, 6298, 7241 и 9473, m / z были обнаружены у всех членов комплекс. Важно отметить, что 10 специфических биомаркеров связаны с конкретными членами К.пневмонии комплекса не выявлено. Эти пики находились в диапазоне 3835–9553 м / з . Исходя из текущего набора данных, специфичность и чувствительность их распределения по филогруппам колебались между 97–100 и 80–100% соответственно (рис. 1 и таблица 1). Kp1 (4153 и 8305 m / z ), Kp2 (4136 и 8271 m / z ), Kp4 (7670 и 3835 m / z ) и Kp5 (4777 и 9553 m / z ) каждый представлены два конкретных пика, которые могут позволить их однозначную идентификацию.Интересно, что все обнаруженные парные пики (Kp1, Kp2, Kp4 и Kp5) всегда демонстрировали приблизительно половину отношения m / z другого пика, которое могло бы соответствовать одиночным и двойным заряженным ионам белка, что часто наблюдается в MALDI-TOF MS эксперименты (Fagerquist, 2017). Штаммы Kp3 имели общий пик, который наблюдался только в Kp5 (7768 m / z ). Наконец, у Kp6 был диагностический пик (5278 m / z ), общий с Kp1. Таким образом, Kp3 и Kp6 могут быть идентифицированы по критериям исключения (отсутствуют пики, специфичные для Kp5 и Kp1, соответственно) (Рисунок 1 и Таблица 1).Эти данные показывают возможность точной идентификации изолята комплекса K. pneumoniae на основе конкретной комбинации вышеописанных пиков. Насколько нам известно, впервые описываются биомаркеры масс-спектрометрии, которые различают все филогруппы комплекса K. pneumoniae . Кроме того, кластерный анализ сгруппировал все штаммы в соответствии с их филогруппой (дополнительная фигура S1), демонстрируя потенциал сравнения всего спектра для идентификации штамма на уровне филогруппы.
Рис. 1. Пиковые положения ( m / z ) для каждого из комплексных штаммов Klebsiella pneumoniae . Звезды обозначают те пики, которые полезны для дискриминации среди филогрупп, как подробно показано в таблице 1.
Таблица 1. Биомаркеры пика масс-спектрометрии MALDI-TOF, полезные для различения филогрупп Klebsiella pneumoniae .
Около половины пиков, визуализируемых в бактериальном спектре в диапазоне m / z , использованном в этой работе (2000–20 000), соответствуют рибосомным белкам (van Belkum et al., 2017). Здесь мы смогли предположительно идентифицировать четыре из конкретных пиков как рибосомные белки (S20, S22 и L31, соответственно 4777/9553, 5278 и 7768 m / z , специфичные для Kp5, Kp1 + Kp6 и Kp3 + Kp5 ). Фактически, 5278 m / z — Kp1 / Kp6 специфический пик, предположительно идентифицированный как рибосомный белок S22, наблюдался в Kp2, Kp3 и Kp5 при 5250 m / z и в Kp4 при 5190 m / z (не специфично), подтверждая информацию, полученную при выравнивании белка (дополнительная фигура S2).Что касается 7768 m / z Kp3 / Kp5 специфического пика, принятого в качестве рибосомного белка L31, он был обнаружен в оставшихся филогруппах при 7738 m / z, , тогда как деметионированная форма S20 наблюдалась при 4769/9536 m / z Кроме того, мы заметили, что S22 отсутствует в трех изолятах Kp1 или Kp6, что может объясняться тем фактом, что S22 является индуцированным в стационарной фазе белком (Yutin et al., 2012).
Что касается специфических пиковых пар Kp1, Kp2 и Kp4, мы предположительно идентифицировали специфичные маркеры Kp1 и Kp2 как YjbJ, предполагаемый белок ответа на стресс, последовательность которого отличается между двумя группами и оставшимися филогруппами (присутствует в 4107/8213 m / z ).Специфичные для Kp4 пики были идентифицированы как зрелая форма белка YdgH (белка, содержащего домен DUF1471), периплазматического белка, участвующего в патогенезе, наблюдаемого в спектрах других филогрупп при 3851/7702 m / z вместо 3835/7670 m / z (таблица 1 и дополнительный рисунок S2).
Специфичность пиков подтверждается выравниванием белка, полученным из последовательностей целого генома (дополнительная фигура S2). Интересно, что специфический пик 4153 m / z Kp1 также наблюдался с низкой интенсивностью в трех повторностях изолята SB11-Kp2 (рис. 1).Однако анализ последовательности белка YjbJ (локус-метка — KQQSB11_50044) выявил 100% идентичность с другими штаммами Kp2 и теоретическую молекулярную массу 8274 Да (4137 в форме двухзарядных ионов). Кроме того, этот пик присутствовал только при 4153 m / z, , подтверждая гипотезу о неспецифическом пике в изоляте SB11 Kp2.
В предыдущей работе было описано восемь специфических пиков, предположительно соответствующих четырем различным белкам, в том числе три рибосомных (L31, S15, L28) и YjbJ, для выделения Kp1 из Kp3 (Dinkelacker et al.2018). Однако в наших экспериментах по MALDI-TOF MS нам не удалось обнаружить предположительно деметионированную форму S15 (10077/5038 m / z — Kp1 и 10062/5031 m / z — Kp3) или L28 (8875 / 4437 m / z — Kp1 и 8891/4447 m / z — Kp3) рибосомные белки. Однако мы подтвердили, что выравнивание последовательностей в наших геномах показало в случае S15 (10209 Да — Kp1, Kp2, Kp4, Kp6) одно аминокислотное изменение для Kp3 (S79A, 10192 Да) и для Kp5 (A80S, 10225). Da). В случае L28 одно аминокислотное изменение отличало Kp1 / Kp2 / Kp4 (9007 Да) от Kp3 / Kp5 / Kp4 (A69S, 9022 Да), таким образом, не являясь специфичным для какой-либо филогруппы, хотя мы не смогли обнаружить его в наших спектрах.
Используя процедуру перекрестной проверки для классификатора SVM, был найден показатель правильных прогнозов 98,1% (среднее из 10 экспериментов; диапазон: 96,9–100%) для филогрупп, что показывает, что этот подход является многообещающим для идентификации K. pneumoniae участников комплекса. Кроме того, использовался независимый проверочный набор данных из 49 изолятов, идентифицированных на уровне филогруппы с помощью анализа последовательности всего генома. Бактерии выращивали в LB или кровяном агаре и либо экстрагировали белком, либо непосредственно анализировали.В соответствии с результатами, полученными для изолятов модели, база данных MALDI Biotyper Compass идентифицировала изоляты либо как K. pneumoniae (39 штаммов, все изоляты Kp1, Kp2 и Kp4), либо как K. variicola (10 штаммов) все изоляты Kp3 и Kp5) с показателями идентификации в диапазоне от 1,82 до 2,55 (средний диапазон 2,34). Напротив, проекция спектров набора проверочных данных в нашей модели с использованием классификатора SVM показала, что все изоляты были правильно идентифицированы на уровне филогруппы с высокой достоверностью.Эта полная идентификация была получена во всех экспериментальных условиях. Результаты этой внешней проверки демонстрируют потенциал MALDI-TOF MS как точного метода идентификации филогруппы K. pneumoniae . Кроме того, они показывают, что используемые питательные среды, а также две разные процедуры подготовки образцов, по-видимому, не влияют на результаты идентификации. Таким образом, использование процедуры прямого переноса с кровяного агара, состояния, наиболее часто используемого в обычных лабораторных условиях, представляется целесообразным для К.пневмония идентификация по MALDI-TOF MS.
Заключение
Эта работа демонстрирует существование белковых биомаркеров, специфичных для филогрупп K. pneumoniae, которые можно обнаружить с помощью MALDI-TOF MS. Это открытие дает возможность промышленным, ветеринарным или медицинским микробиологическим лабораториям идентифицировать изоляты комплекса K. pneumoniae на уровне видов или филогрупп. Мы призываем эти эталонные спектры различных таксонов К.комплекс pneumoniae должен быть включен в справочные базы данных спектров MALDI-TOF. Улучшенная идентификация K. pneumoniae и родственных таксонов улучшит наше понимание эпидемиологии, экологии и связей с патогенезом этой все более важной группы патогенов.
Вклад автора
CR выполнил экспериментальную работу, связанную с получением масс-спектров в MALDI-TOF MS, выполнил анализ биоинформатики и написал рукопись.VP и AR выполнили экспериментальную работу, связанную с обработкой образцов, WGS и MALDI-TOF MS. СБ координировал дизайн исследования и методологический подход, анализ данных и пересмотр рукописи. Все авторы прочитали и одобрили окончательный вариант этой рукописи.
Финансирование
Эта работа была финансово поддержана проектом MedVetKlebs, компонентом Европейской совместной программы One EJP Health, который получил финансирование от исследовательской и инновационной программы Horizon 2020 Европейского Союза в рамках грантового соглашения №.773830.
Заявление о конфликте интересов
Авторы заявляют, что исследование проводилось в отсутствие каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могут быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов.
Благодарности
Мы благодарим Центр биологических ресурсов Института Пастера (Chantal Bizet и Estelle Muhle) за поддержку в рамках инструмента MALDI-TOF MS. Мы благодарим Жан-Марка Коллара (Институт Мадагаскара Пастера), С. Уэсли Лонга (Хьюстонская методистская больница) и Дэвида А.Rasko и J. Kristie Johnson (Медицинский факультет Университета Мэриленда, Балтимор, Мэриленд, США) за любезное предоставление штаммов, проанализированных в этом исследовании. Часть результатов, опубликованных в этой рукописи, доступна онлайн в рамках публикации препринта по адресу https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2018/06/19/350579.full.pdf, которая также упоминается в текст.
Дополнительный материал
Дополнительный материал для этой статьи можно найти в Интернете по адресу: https: //www.frontiersin.org / статьи / 10.3389 / fmicb.2018.03000 / полный номер дополнительного материала
Сноски
- https://www.bruker.com/fileadmin/user_upload/1-Products/Separations_MassSpectrometry/MALDI_Biotyper/US_CA_System/MBT_list_of_organisms_10_2017.pdf
- http://web.expasy.org/tagident/
Отзывы
Беккер Л., Фукс С., Пфейфер Ю., Семмлер Т., Экманнс Т., Корр Г. и др. (2018). Анализ последовательности всего генома изолятов клебсиелл, продуцирующих CTX-M-15, позволил проанализировать сценарий поликлональной вспышки. Фронт. Microbiol. 9: 322. doi: 10.3389 / fmicb.2018.00322
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Berry G.J., Loeffelholz M.J. и Williams-Bouyer N. (2015). Исследование лабораторной неверной идентификации инфекции клебсиеллы варикозного кровотока. J. Clin. Microbiol. 53, 2793–2794. doi: 10.1128 / JCM.00841-15
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Биалек-Давенет С., Крискуоло А.Ailloud, F., Passet, V., Jones, L., Delannoy-Vieillard, A.S., et al. (2014A). Геномное определение гипервирулентной и множественной лекарственной устойчивости клональных групп Klebsiella pneumoniae . Emerg. Infect. Дис. 20, 1812–1820. doi: 10.3201 / eid2011.140206
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Bialek-Davenet, S., Criscuolo, A., Ailloud, F., Passet, V., Nicolas-Chanoine, M.H., Decré, D., et al. (2014b). Разработка мультиплексного ПЦР-анализа для идентификации гипервирулентных клонов Klebsiella pneumoniae капсульного серотипа К2. J. Med. Microbiol. 63, 1608–1614. doi: 10.1099 / jmm.0.081448-0
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Blin, C., Passet, V., Touchon, M., Rocha, E.P. and Brisse, S. (2017). Метаболическое разнообразие возникающих патогенных линий Klebsiella pneumoniae . Environ. Microbiol. 19, 1881–1898. doi: 10.1111 / 1462-2920.13689
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Breurec, S.Melot B., Hoen B., Passet V., Schepers K., Bastian S. и др. (2016). Абсцесс печени, вызванный инфекцией, приобретенной сообществом Klebsiella quasipneumoniae subsp. квазипневмоний . Emerg. Infect. Дис. 22, 529–531. doi: 10.3201 / eid2203.151466
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Brisse S., Passet V. и Grimont P. A. D. (2014). Описание Klebsiella quasipneumoniae sp. nov., новый вид, выделенный из человеческих инфекций, с двумя подвидами Klebsiella quasipneumoniae subsp. квазипневмоний подп. ноябрю и Klebsiella quasipneumoniae subsp. similipneumoniae subsp. nov. и a. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 64, 3146–3152. doi: 10.1099 / ijs.0.062737-0
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Brisse, S., van Himbergen, T., Kusters, K. и Verhoef, J. (2004). Разработка метода быстрой идентификации для филогенетических групп Klebsiella pneumoniae и анализ 420 клинических изолятов. Clin. Microbiol. Infect. 10, 942–945. doi: 10.1111 / j.1469-0691.2004.00973.x
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Brisse S. и Verhoef J. (2001). Филогенетическое разнообразие клинических изолятов Klebsiella pneumoniae и Klebsiella oxytoca , выявленных путем случайного амплификации полиморфного секвенирования генов ДНК, gyrA и parC и автоматического риботипирования. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51, 915–924. doi: 10.1099 / 00207713-51-3-915
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
DeMarco, M.Л. и Форд Б. А. (2013). Вне идентификации: новые и будущие применения для мальтийской масс-спектрометрии в лаборатории клинической микробиологии. Clin. Лаборатория Med. 33, 611–628. doi: 10.1016 / j.cll.2013.03.013
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Dinkelacker, A.G., Vogt, S., Oberhettinger, P., Mauder, N., Rau, J., Kostrzewa, M., et al. (2018). Типирование и видовая идентификация клинических изолятов клебсиелл с помощью инфракрасной спектроскопии с Фурье-преобразованием (FTIR) и масс-спектрометрии с лазерной десорбцией / ионизацией по времени пролета (MALDI-TOF). J. Clin. Microbiol. 56: e00843-18. doi: 10.1128 / JCM.00843-18
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Европейский центр профилактики и контроля заболеваний [ECDC] (2017). «Эпиднадзор за устойчивостью к противомикробным препаратам в Европе, 2016 г.», Материалы ежегодного отчета Европейской сети эпиднадзора за устойчивостью к антимикробным препаратам (EARS-Net) (муниципалитет Солна: Европейский центр по профилактике и контролю заболеваний), doi: 10.2900 / 296939
CrossRef Полный текст | Google Scholar
Fagerquist, C.К. (2017). Разблокировка протеомной информации, закодированной в данных MALDI-TOF-MS, используемых для идентификации и характеристики микробов. Expert Rev. Proteomics 14, 97–107. doi: 10.1080 / 14789450.2017.1260451
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Фонсека, Е. Л., Рамос, Н. Д., Андраде, Б. Г., Морайс, Л. Л., Марин, М. Ф. и Висенте, А. С. (2017). Одностадийная мультиплексная ПЦР для выявления Klebsiella pneumoniae , Klebsiella variicola и Klebsiella quasipneumoniae в клинической практике. Диаг. Microbiol. Infect. Дис. 87, 315–317. doi: 10.1016 / j.diagmicrobio.2017.01.005
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Гарза-Рамос У., Сильва-Санчес Ж., Мартинес-Ромеро Э., Тиноко П., Пина-Гонсалес М., Барриос Х. и др. (2015). Разработка системы зондов Multiplex-PCR для правильной идентификации Klebsiella variicola . BMC Microbiol. 15:64. doi: 10.1186 / s12866-015-0396-6
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Haeggman, S., Lofdahl, S., Paauw, A., Verhoef, J. и Brisse, S. (2004). Разнообразие и эволюция класса хромосомного гена бета-лактамазы у Klebsiella pneumoniae . Антимикроб. Агенты Chemother. 48, 2400–2408. doi: 10.1128 / AAC.48.7.2400-2408.2004
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Holt, K.E., Wertheim, H., Zadoks, R.N., Baker S., Whitehouse, C.A., Dance, D., et al. (2015). Геномный анализ разнообразия, структуры населения, вирулентности и устойчивости к противомикробным препаратам у Klebsiella pneumoniae , представляющей серьезную угрозу для общественного здравоохранения. Proc. Natl. Акад. Sci. США 112, E3574-E3581. doi: 10.1073 / pnas.1501049112
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Long, S.W., Linson, S.E., Ojeda Saavedra, M., Cantu, C., Davis, J.J., Brettin, T., et al. (2017a). Секвенирование всего генома клинического изолята человека нового вида Klebsiella quasivariicola sp. ноябрю Genome Announc. 5: e01057-17. doi: 10.1128 / genomeA.01057-17
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Long, S.W., Linson, S.E., Ojeda Saavedra, M., Cantu, C., Davis, J.J., Brettin, T., et al. (2017b). Секвенирование всего генома клинических изолятов Klebsiella pneumoniae человека выявляет ошибочную идентификацию и неправильное понимание Klebsiella pneumoniae , Klebsiella variicola и Klebsiella quasipneumoniae . mSphere 2: e00290-17. doi: 10.1128 / mSphereDirect.00290-17
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Maatallah, M., Vading, M., Kabir, M.H., Bakhrouf, A., Kalin, M., Nauclér, P., et al. (2014). Klebsiella variicola является частой причиной инфекции кровотока в районе Стокгольма и связана с более высокой смертностью по сравнению с K. pneumoniae . PLOS One 9: 113539. doi: 10.1371 / journal.pone.0113539
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Rodrigues C., Passet V. and Brisse S. (2018). Идентификация членов комплекса Klebsiella pneumoniae с помощью масс-спектрометрии MALDI-TOF. bioRxiv [Препринт]. doi: 10.1101 / 350579
CrossRef Полный текст | Google Scholar
Розенблют М., Мартинес Л., Сильва Дж. И Мартинес-Ромеро Э. (2004). Klebsiella variicola , новый вид с клиническими и растительными изолятами. Сист. Appl. Microbiol. 27, 27–35. doi: 10.1078 / 0723-2020-00261
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Секи М., Гото К., Накамура С., Акеда Ю., Йошии Т., Miyaguchi S., et al. (2013). Смертельный сепсис, вызванный необычным видом клебсиелл, который был неправильно идентифицирован автоматизированной системой идентификации. J. Med. Microbiol. 62, 801–803. doi: 10.1099 / jmm.0.051334-0
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
van Belkum, A., Welker, M., Pincus, D., Charrier, J.P. and Girard, V. (2017). Масс-спектрометрия времяпролетной лазерной десорбционной ионизации с помощью матрицы при клинической микробиологии: каковы текущие проблемы? Ann.Лаборатория Med. 37, 475–483. doi: 10.3343 / alm.2017.37.6.475
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
Vranckx, K., De Bruyne, K. и Pot, B. (2017). «Анализ спектров MALDI-TOF MS с использованием программного обеспечения бионумеров», в , MALDI-TOF MS Clinical Microbiology , eds H.N. Shah and S.E. Gharbia (Hoboken, NJ: John Wiley & Sons), 539–562. doi: 10.1002 / 9781118960226.ch31
PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar
,Исследователи из Королевского университета в Белфасте разработали новейшую медицинскую терапию, которая может защитить пациентов больниц Великобритании от смертельного супербуга.
Новое лечение, в котором используется молекула, называемая ингибитором, для предотвращения блокирования естественной защитой организма суперкубка Klebsiella pneumonia , способного ежегодно спасать тысячи жизней в Великобритании.Клебсиелла с уровнем смертности 25-60% может вызывать инфекции мочевого пузыря и пневмонию и устойчива ко всем основным антибиотикам.
Исследовательская группа из Школы медицины, стоматологии и биомедицинских наук в Queen’s обнаружила, что Klebsiella может выживать в белых кровяных клетках, называемых «макрофагами», которые предназначены для защиты организма человека от инфекции. Супербаг поглощает белок в клетке крови, который называется «Акт», парализует клетку и делает ее идеальным укрытием, чтобы избежать гибели от антибиотиков.
Команда показала, что, обработав клетку ингибитором, который останавливает работу белка «Akt», клетка крови снова способна убить клебсиелл , и инфекция может быть полностью устранена.
Руководитель группы, профессор Хосе Бенгоеча из Школы медицины, стоматологии и биомедицинских наук в Queen’s, сказал: «Глобальная проблема устойчивости к противомикробным препаратам быстро становится одной из основных проблем здравоохранения в наше время. Особую озабоченность вызывает растущая распространенность инфекций, вызванных Klebsiella pneumonia , которые были определены правительством Великобритании и Всемирной организацией здравоохранения как неотложная угроза здоровью человека из-за чрезвычайно устойчивых к лекарствам штаммов.
«Наши исследования помогли нам лучше понять уязвимые пути защиты человека, что означает, что мы смогли разработать потенциально революционную новую терапию, которая заблокирует ошибку и остановит ее на своем пути. Это последний пример о приверженности исследователей и сотрудников Queen’s продвижению знаний и достижению совершенства на благо общества «.
Исследовательская группа из плана Queen проведет доклинические испытания в течение следующих месяцев, чтобы дополнительно подтвердить свои выводы и перенести терапию в клинические испытания на людях.
История Источник:
Материалы предоставлены Королевским университетом Белфаста . Примечание: содержимое может быть отредактировано по стилю и длине.
,